La GPNCL combine notre expertise en chimie médicale et chémoinformatique, et nos connaissances en pharmacognosie pour créer une source unique de composés purs et divers, pour la découverte de touches et de têtes de série.
Pour concevoir cette chimiothèque, nous avons rassemblé 450 000 structures de composés naturels dans notre base de données et utilisé des outils chémoinformatiques pour ainsi sélectionner un sous-ensemble de molécules chimiquement diverses et « drug-like ».
Nous avons écarté les acides aminés, peptides, acides nucléiques, les acides gras à chaîne longue ainsi que les métaux.
Nous avons pris soin de sélectionner différentes familles phytochimiques, dans l’idée de représenter le plus de familles chimiques possible.
Un stock de chaque molécule est conservé pour le réapprovisionnement.
Les composés de la chimiothèque sont des composés naturels, des informations sur la provenance des molécules sont fournies (famille, gènes, espèces, organe…)
Les applications:
Hit to lead, chémogénomique
Les avantages :
Diversité chimique importante, molecules « drug-like », possibilité de réapprovisionnement
Caractéristiques techniques :
Chaque plaque contient 80 molécules. Chaque puits contient 500 µL (ou 20 µL) de solution DMSO à 5mM en produit. Cette forte concentration permet facilement d’effectuer des dilutions jusqu’à atteindre des concentrations s’affranchissant des effets du DMSO.
- Pureté supérieure à 90%
- Diversité chimique
- « Drug-like »
- Possibilité de personnaliser la chimiothèque
Données fournies :
Notre produit est fourni avec un fichier électronique (SDF, XLS ou PDF) contenant le nom des différentes molécules, ainsi que leur structure et position sur la plaque. Ce fichier contient également les sources biologiques connues de chaque composé, et des descripteurs physico-chimiques calculés.
Propriétés physico-chimiques et distribution phytochimique :
Le tableau suivant représente le profil physico-chimique et la distribution des molécules de GPNCL d’un point de vue phytochimique. Les alcaloïdes représentent la famille la plus conséquente de la chimiothèque puisqu’ils représentent la famille phytochimique la plus diverse en terme de structure suivis par les terpenes.